UTL PROBABILITY AND STATISTICS Seminar

Friday, May 6, 2011

Estimação de biodiversidade: deslindando o repertório dos receptores das células T


Carlos Daniel Paulino
(Departamento de Matemática, IST e Centro de Estatística e Aplicações, FCUL)

Abstract: A estimação da diversidade das células T, designadamente dos seus receptores (TCR), é essencial para compreender a actuação do sistema imunitário no seu combate a agentes patogénicos estranhos. Esta questão tem sido frequentemente manejada sob a suposição de que todas as "espécies" de TCR (os denominados clonotipos) estão igualmente representadas nos organismos multicelulares, mas vários estudos experimentais têm apontado para um padrão heterogéneo de diversidade. Neste sentido, resolveu-se contemplar modelos de abundância poissoniana transferidos da Ecologia para estimar quer a diversidade do repertório dos TCR quer a distribuição da frequência de clonotipos com cada nível de ocorrência nas células T (i.e., por tamanho clonal). Estes modelos paramétricos foram comparados com um modelo semiparamétrico obtido por uma mistura poissoniana por um processo Dirichlet através de uma análise bayesiana, assente em distintas distribuições a priori para a diversidade, aplicada a dados de linfócitos controladores (T4) e assassinos (T8) colhidos de um ratinho.

Friday, May 6, 2011
Time: 14h30
Room: Sala 27, Edifício Principal, ISA
http://cemapre.iseg.ulisboa.pt/seminars/pe-utl/